RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dsg1aQ61495 1057 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 BC048507Q80ZS7 89 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Strip2Q8C9H6 844 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mmgt1Q8K273 131 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dppa3Q8QZY3 150 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Plod1Q9R0E2 728 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm1758F6VZZ1 202 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PorP37040 678 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm136Q3V037 328 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam49aQ8BHZ0 323 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CenpuQ8C4M7 410 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc2a5Q9WV38 501 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Map3k10Q66L42 940 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrrn2Q6PHP6 730 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Acot5Q6Q2Z6 421 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SgczQ8BX51 311 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 P3h2Q8CG71 703 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 FdpsQ920E5 353 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nsmce3Q9CPR8 279 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scyl3Q9DBQ7 735 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prkab1Q9R078 270 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tk2Q9R088 270 aa9.85□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Plcg1Q62077 1302 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm16430A6X8J1 155 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Impdh2P24547 514 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Celf1P28659 486 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Samhd1Q60710 627 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Krt75Q8BGZ7 551 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Map10Q8BJS7 891 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 N4bp3Q8C7U1 537 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Actl9Q8CG27 415 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abhd2Q9QXM0 425 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ercc4Q9QZD4 917 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gnrh1P13562 90 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pdcd2P46718 343 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kcnk9Q3LS21 402 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim75Q3UWZ0 467 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tfdp2Q64163 446 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gprasp2Q8BUY8 826 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bbs7Q8K2G4 715 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 OtoaQ8K561 1137 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 OafQ8QZR4 282 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tjap1Q9DCD5 539 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rfx8D3YU81 596 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rad51ap2G3UW63 976 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 E230025N22RikG5E8S3 482 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SftpdP50404 374 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Irx2P81066 474 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Wdr41Q3UDP0 460 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tigd5Q499M4 642 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ces5aQ6AW46 575 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mapk4Q6P5G0 583 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CntrobQ8CB62 887 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PdxkQ8K183 312 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dthd1E9PZX1 795 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp558E9Q1J0 407 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nrg3O35181 713 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Msx3P70354 204 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2c67Q569X9 491 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ppme1Q8BVQ5 386 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CbsQ91WT9 561 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rgs10Q9CQE5 181 aa9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3187M0QWW3 260 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CraddO88843 199 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptgs2Q05769 604 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nt5c2Q3V1L4 560 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim36Q80WG7 729 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Armc6Q8BNU0 468 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nlrp4aQ8BU40 982 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc38a7Q8BWH0 463 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AmotQ8VHG2 1126 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ChiaQ91XA9 473 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zmat2Q9CPW7 199 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atp11cQ9QZW0 1129 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serpinb3aG3X9V8 387 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim43cP86449 446 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa9.83□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms