RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA YPL150WQ12152 901 aa1.91□□□□□ -2.1
15S_rRNA15S_rRNA NUP157P40064 1391 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YAL064W-BO13512 126 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RPC40P07703 335 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RRT12P25381 491 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA ICL1P28240 557 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA PEX3P28795 441 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA CAM1P29547 415 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA PEX18P38855 283 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA PCL7P40186 285 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA MRX5P47007 382 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YGL185CP53100 379 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA ISD11Q6Q560 94 aa1.9□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA PAN1P32521 1480 aa1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA TDH1P00360 332 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RPS3P05750 240 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA BMH1P29311 267 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA ERV25P54837 211 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SDC1Q03323 175 aa1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA VBA1Q04301 562 aa1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SEC10Q06245 871 aa1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA CDD1Q06549 142 aa1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YSR3P23501 404 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YKL070WP36087 169 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA MND1P53102 219 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA PEX31P53203 462 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA FMP16Q12497 93 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YOS9Q99220 542 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA FMP33P46998 180 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA FMP41P53889 259 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SFH1Q06168 426 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA LOA1Q06508 300 aa1.88□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA CSG2P35206 410 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA HMT1P38074 348 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA ATG12P38316 186 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SHC1P39000 512 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA LSB1P53281 241 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RGM1Q00453 211 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA PER33Q12144 273 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA AGC1Q12482 902 aa1.87□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SSA3P09435 649 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YER188WP40103 239 aa1.86□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SPP2Q02521 185 aa1.86□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YPL039WQ03080 316 aa1.86□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SMT3Q12306 101 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YBL112CQ3E7Y4 105 aa1.86□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA TOM40P23644 387 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA CLB6P32943 380 aa1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA ARN2P38724 620 aa1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SPT8P38915 602 aa1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA NPT1P39683 429 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SER33P40510 469 aa1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA PIR5P46999 287 aa1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA TIM21P53220 239 aa1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SSU72P53538 206 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa1.85□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RPL26AP05743 127 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RPL4AP10664 362 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA SNF6P18888 332 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA POF1P25576 258 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA COY1P34237 679 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA HSM3P38348 480 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA MED6P38782 295 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA MNN5P46982 586 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RPL4BP49626 362 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RPL26BP53221 127 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA GMC2Q06201 188 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA YOL019WQ08157 551 aa1.84□□□□□ -2.11
15S_rRNA15S_rRNA RPP0P05317 312 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA DPM1P14020 267 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA SFC1P33303 322 aa1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA DRE2P36152 348 aa1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA TAD2P47058 250 aa1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA NBP35P52920 328 aa1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA SLX9P53251 210 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA MNT4P53745 580 aa1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA CTS2Q06350 511 aa1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA COS2P0CX12 379 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA COS3P0CX13 379 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA MET16P18408 261 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA PET100P38958 111 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA TEM1P38987 245 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA AGX1P43567 385 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA KAP114P53067 1004 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA SWS2P53937 143 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA CDC14Q00684 551 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA YMR166CQ03829 368 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA SPO77Q06134 477 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA ARV1Q06541 321 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA YOR268CQ08734 132 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA TY3A-GQ12173 290 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA SME1Q12330 94 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA TY3A-IQ99219 290 aa1.83□□□□□ -2.12
15S_rRNA15S_rRNA SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.4 ms