RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR241CP38142 488 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CHL4P38907 458 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ALP1P38971 573 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YCK3P39962 524 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO73P40031 143 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ATF1P40353 525 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P GLR1P41921 483 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P FAR7P43592 221 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P LOH1P47055 219 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MDE1P47095 244 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BNA2P47125 453 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P GPI8P49018 411 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RMR1P53060 241 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PEF1P53238 335 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P VOA1P53262 265 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PET191Q02772 108 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SNZ1Q03148 297 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR279CQ03263 540 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ABZ2Q03266 374 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P OST6Q03723 332 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P GPI17Q04080 534 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR114CQ04597 100 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RSA3Q05942 220 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SNA4Q07549 140 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL159C-AQ3E769 90 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P FSH3Q99369 266 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DSF1P0CX08 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR073CP0CX09 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SNF4P12904 322 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P HNM1P19807 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P STE50P25344 346 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS5P26783 225 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PTP2P29461 750 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CLG1P35190 452 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P AMN1P38285 549 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YER184CP39961 794 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YER188WP40103 239 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P QDR1P40475 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SLM1P40485 686 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P AAD14P42884 376 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SWP82P43554 623 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC5P43610 853 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CHA4P43634 648 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ABM1P47146 123 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YIP5P53108 310 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SAY1P53324 424 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ASI2P53895 289 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RNH201P53942 307 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P APM1Q00776 475 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DIG2Q03373 323 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR239CQ03780 787 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YPQ2Q06328 317 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PSR1Q07800 427 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC25Q07951 179 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MCH4Q08268 501 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P VIK1Q12045 647 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ACF2Q12168 779 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RRI1Q12468 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P LSO1Q3E827 93 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BLM10P43583 2143 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MES1P00958 751 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RAS1P01119 309 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SAM35P14693 329 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPL6P32904 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MLH1P38920 769 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P THO1P40040 218 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RRG9P40156 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SDP1P40479 209 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YRB2P40517 327 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P OST1P41543 476 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RET2P43621 546 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YIP4P53093 235 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TYW3P53177 273 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR064CP53750 290 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RSM23Q01163 450 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P GRX5Q02784 150 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P HOT1Q03213 719 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM36Q03798 255 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P FIN1Q03898 291 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ELP6Q04868 273 aa2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.1 ms