RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR241CP38142 488 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M CHL4P38907 458 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ALP1P38971 573 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YCK3P39962 524 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO73P40031 143 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ATF1P40353 525 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M GLR1P41921 483 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M FAR7P43592 221 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M LOH1P47055 219 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MDE1P47095 244 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BNA2P47125 453 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI8P49018 411 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RMR1P53060 241 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PEF1P53238 335 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M VOA1P53262 265 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PET191Q02772 108 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SNZ1Q03148 297 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR279CQ03263 540 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ABZ2Q03266 374 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M OST6Q03723 332 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI17Q04080 534 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR114CQ04597 100 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RSA3Q05942 220 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SNA4Q07549 140 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL159C-AQ3E769 90 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M FSH3Q99369 266 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M DSF1P0CX08 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR073CP0CX09 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SNF4P12904 322 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M HNM1P19807 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M STE50P25344 346 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS5P26783 225 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PTP2P29461 750 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M CLG1P35190 452 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M AMN1P38285 549 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YER184CP39961 794 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YER188WP40103 239 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M QDR1P40475 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SLM1P40485 686 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M AAD14P42884 376 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SWP82P43554 623 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC5P43610 853 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M CHA4P43634 648 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ABM1P47146 123 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YIP5P53108 310 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SAY1P53324 424 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ASI2P53895 289 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RNH201P53942 307 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M APM1Q00776 475 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M DIG2Q03373 323 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR239CQ03780 787 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YPQ2Q06328 317 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PSR1Q07800 427 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC25Q07951 179 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MCH4Q08268 501 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M VIK1Q12045 647 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ACF2Q12168 779 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RRI1Q12468 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M LSO1Q3E827 93 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BLM10P43583 2143 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MES1P00958 751 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RAS1P01119 309 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SAM35P14693 329 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL6P32904 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MLH1P38920 769 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M THO1P40040 218 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RRG9P40156 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SDP1P40479 209 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YRB2P40517 327 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M OST1P41543 476 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RET2P43621 546 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YIP4P53093 235 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TYW3P53177 273 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR064CP53750 290 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM23Q01163 450 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M GRX5Q02784 150 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M HOT1Q03213 719 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM36Q03798 255 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M FIN1Q03898 291 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ELP6Q04868 273 aa2.22□□□□□ -2.05
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