RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR241CP38142 488 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K CHL4P38907 458 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ALP1P38971 573 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YCK3P39962 524 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO73P40031 143 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ATF1P40353 525 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K GLR1P41921 483 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K FAR7P43592 221 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K LOH1P47055 219 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MDE1P47095 244 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K BNA2P47125 453 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K GPI8P49018 411 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RMR1P53060 241 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K PEF1P53238 335 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K VOA1P53262 265 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K PET191Q02772 108 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SNZ1Q03148 297 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR279CQ03263 540 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ABZ2Q03266 374 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K OST6Q03723 332 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K GPI17Q04080 534 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR114CQ04597 100 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RSA3Q05942 220 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SNA4Q07549 140 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL159C-AQ3E769 90 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K FSH3Q99369 266 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DSF1P0CX08 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR073CP0CX09 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SNF4P12904 322 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K HNM1P19807 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K STE50P25344 346 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS5P26783 225 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K PTP2P29461 750 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K CLG1P35190 452 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K AMN1P38285 549 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YER184CP39961 794 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YER188WP40103 239 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K QDR1P40475 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SLM1P40485 686 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K AAD14P42884 376 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SWP82P43554 623 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC5P43610 853 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K CHA4P43634 648 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ABM1P47146 123 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YIP5P53108 310 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SAY1P53324 424 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ASI2P53895 289 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RNH201P53942 307 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K APM1Q00776 475 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DIG2Q03373 323 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR239CQ03780 787 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YPQ2Q06328 317 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K PSR1Q07800 427 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC25Q07951 179 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MCH4Q08268 501 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K VIK1Q12045 647 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ACF2Q12168 779 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RRI1Q12468 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K LSO1Q3E827 93 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K BLM10P43583 2143 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MES1P00958 751 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RAS1P01119 309 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SAM35P14693 329 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL6P32904 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MLH1P38920 769 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K THO1P40040 218 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RRG9P40156 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SDP1P40479 209 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YRB2P40517 327 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K OST1P41543 476 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RET2P43621 546 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YIP4P53093 235 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TYW3P53177 273 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR064CP53750 290 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RSM23Q01163 450 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K GRX5Q02784 150 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K HOT1Q03213 719 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM36Q03798 255 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K FIN1Q03898 291 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K ELP6Q04868 273 aa2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.1 ms