RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR241CP38142 488 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CHL4P38907 458 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ALP1P38971 573 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YCK3P39962 524 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO73P40031 143 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ATF1P40353 525 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J GLR1P41921 483 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J FAR7P43592 221 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J LOH1P47055 219 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MDE1P47095 244 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BNA2P47125 453 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI8P49018 411 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RMR1P53060 241 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PEF1P53238 335 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J VOA1P53262 265 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PET191Q02772 108 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SNZ1Q03148 297 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR279CQ03263 540 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ABZ2Q03266 374 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J OST6Q03723 332 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI17Q04080 534 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR114CQ04597 100 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RSA3Q05942 220 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SNA4Q07549 140 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL159C-AQ3E769 90 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J FSH3Q99369 266 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DSF1P0CX08 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR073CP0CX09 502 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF4P12904 322 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J HNM1P19807 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J STE50P25344 346 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS5P26783 225 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PTP2P29461 750 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CLG1P35190 452 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J AMN1P38285 549 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YER184CP39961 794 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YER188WP40103 239 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J QDR1P40475 563 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SLM1P40485 686 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J AAD14P42884 376 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SWP82P43554 623 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC5P43610 853 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CHA4P43634 648 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ABM1P47146 123 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YIP5P53108 310 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SAY1P53324 424 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ASI2P53895 289 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RNH201P53942 307 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J APM1Q00776 475 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DIG2Q03373 323 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR239CQ03780 787 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YPQ2Q06328 317 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PSR1Q07800 427 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC25Q07951 179 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MCH4Q08268 501 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J VIK1Q12045 647 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ACF2Q12168 779 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RRI1Q12468 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J LSO1Q3E827 93 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BLM10P43583 2143 aa2.23□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MES1P00958 751 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RAS1P01119 309 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SAM35P14693 329 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL6P32904 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MLH1P38920 769 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J THO1P40040 218 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RRG9P40156 214 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SDP1P40479 209 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YRB2P40517 327 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J OST1P41543 476 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RET2P43621 546 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YIP4P53093 235 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TYW3P53177 273 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR064CP53750 290 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM23Q01163 450 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.22□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J GRX5Q02784 150 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J HOT1Q03213 719 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM36Q03798 255 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J FIN1Q03898 291 aa2.22□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ELP6Q04868 273 aa2.22□□□□□ -2.05
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