RNA–Protein interactions for RNA: YPR080W

TEF1, Transcript of Translational elongation factor EF-1 alpha, yeast

Gene TEF1, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TEF1	YPR080W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	ASR1	Q06834	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	CYK3	Q07533	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	RDR1	Q08904	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	ATG41	Q12048	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	TGS1	Q12052	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	SCM3	Q12334	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	GCN4	P03069	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	CDC9	P04819	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PET54	P10834	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	BOS1	P25385	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	SEF1	P34228	1148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	CLG1	P35190	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PEX32	P38292	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YBR242W	P38331	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	MIT1	P40002	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YER010C	P40011	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YKE4	P40544	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	BAP3	P41815	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PEX25	Q02969	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	SSY1	Q03770	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	HRT1	Q08273	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	GRE1	Q08969	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	HSP42	Q12329	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	MSW1	P04803	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	HIS3	P06633	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	SPO7	P18410	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	RPB8	P20436	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	HSP150	P32478	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	MRPL3	P36516	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	MRPL16	P38064	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	TAT1	P38085	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YFR054C	P43622	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PMT3	P47190	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	DOC1	P53068	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	MTM1	P53320	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	SAY1	P53324	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PLB2	Q03674	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	TRS23	Q03784	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	BNA7	Q04066	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	COX20	Q04935	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	BTS1	Q12051	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	FRE7	Q12333	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SCEI	P03882	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PDX1	P16451	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	UTR1	P21373	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	THI4	P32318	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SPT10	P35208	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SDS24	P38314	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	NAS2	P40555	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SLS1	P42900	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PGU1	P47180	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	LYS5	P50113	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YGR126W	P53274	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SLI1	P53304	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YNL165W	P53891	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SCS7	Q03529	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MDM30	Q05930	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
TEF1	YPR080W	MTR10	Q99189	972 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CHO1	P08456	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	STF2	P16965	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	STE4	P18851	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	DIT1	P21623	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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