RNA–Protein interactions for RNA: YOL056W

GPM3, Transcript of Homolog of Gpm1p phosphoglycerate mutase, yeast

Gene GPM3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPM3	YOL056W	BAG7	Q12128	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RTN2	Q12443	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	FRE6	Q12473	712 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	STE12	P13574	688 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YPK2	P18961	677 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MXR2	P25566	168 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	KRE6	P32486	720 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	UTH1	P36135	365 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	SRL3	P36167	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YBR137W	P38276	179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RPP1	P38786	293 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YNL195C	P40168	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	TOK1	P40310	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	POP1	P41812	875 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	QRI7	P43122	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	IRC6	P43615	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	IRC18	P47056	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PMT5	P52867	743 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	VOA1	P53262	265 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	DCR2	Q05924	578 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	BUR2	Q05949	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	AIM6	Q07716	390 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	SCM3	Q12334	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	SET6	Q12529	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	GCN4	P03069	281 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	COX9	P07255	59 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	DBF2	P22204	572 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YCR006C	P25350	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	ZRT3	P34240	503 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MAL32	P38158	584 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YHR180W	P38868	163 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PZF1	P39933	429 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MIT1	P40002	666 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RPE1	P46969	238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	TPN1	P53099	579 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MAL12	P53341	584 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YAT1	P80235	687 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RSM28	Q03430	361 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	EKI1	Q03764	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RLM1	Q12224	676 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MSW1	P04803	379 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	DAL82	P21705	255 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	STE50	P25344	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
GPM3	YOL056W	HYM1	P32464	399 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PAU2	P32612	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	THI2	P38141	450 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	SIT1	P39980	628 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	CUP9	P41817	306 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PMT6	P42934	759 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	BNA6	P43619	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	CCC1	P47818	322 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MRH4	P53166	561 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	IMO32	P53219	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MTM1	P53320	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	NRM1	P53718	249 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PFA5	Q03289	374 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	IRC19	Q07843	230 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPM3	YOL056W	COX1	P00401	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPM3	YOL056W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GPM3	YOL056W	KIN28	P06242	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPM3	YOL056W	HIS3	P06633	220 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPM3	YOL056W	YCL002C	P25565	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPM3	YOL056W	STP22	P25604	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPM3	YOL056W	EHD3	P28817	500 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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