RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	SEI1	Q06058	285 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MUM3	Q08750	479 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	FRE8	Q12209	686 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RUP1	Q12242	671 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PSF1	Q12488	208 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SKS1	Q12505	502 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	FSH3	Q99369	266 aa		0.82	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YLR302C	O13544	120 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
PAM16	YJL104W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	CKI1	P20485	582 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MRPS28	P21771	286 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MGT1	P26188	188 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	DBF4	P32325	704 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	VMA11	P32842	164 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YBR144C	P34215	104 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	GPX1	P36014	167 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	JNM1	P36224	373 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YCR041W	P37265	110 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RCK1	P38622	512 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	ECM34	P38728	170 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	EFM1	P38732	585 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PEX18	P38855	283 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RBG1	P39729	369 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MET18	P40469	1032 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	BNA1	P47096	177 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SOL1	P50278	321 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	UFD1	P53044	361 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YIP5	P53108	310 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MPS2	P53159	387 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PEX8	P53248	589 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	CAB4	P53332	305 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MEP3	P53390	489 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MRPL19	P53875	158 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YNL046W	P53956	172 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MRPS16	Q02608	121 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YDR239C	Q03780	787 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	GMC2	Q06201	188 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SOR2	Q07786	357 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	COS7	Q07788	383 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	LOT6	Q07923	191 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	REX4	Q08237	289 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	GET4	Q12125	312 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YPR022C	Q12139	1133 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	ATG34	Q12292	412 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RNH203	Q12338	110 aa		0.81	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PDE2	P06776	526 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	STE3	P06783	470 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MSS18	P08593	268 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	UNG1	P12887	359 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	TFS1	P14306	219 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PHO85	P17157	305 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	UGA1	P17649	471 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	APA2	P22108	325 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	MDH2	P22133	377 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YCL068C	P25593	260 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YCR100C	P25606	316 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YCR099C	P25657	155 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	COX13	P32799	129 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SSO1	P32867	290 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	CLB6	P32943	380 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PTH2	P34222	208 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SDH4	P37298	181 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	BNA4	P38169	460 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SMF2	P38778	549 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.8	□□□□□ -2.28	not detected
PAM16	YJL104W	POP1	P41812	875 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YJL055W	P47044	245 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PET130	P47065	347 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	ECM27	P47144	725 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	YML6	P51998	286 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PMT5	P52867	743 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	PCP1	P53259	346 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	COS1	P53822	381 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	VPS71	Q03433	280 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	RCE1	Q03530	315 aa		0.8	□□□□□ -2.28
PAM16	YJL104W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28

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