RNA–Protein interactions for RNA: YFL018C

LPD1, Transcript of Dihydrolipoamide dehydrogenase, yeastyeast

Gene LPD1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPD1YFL018C TGS1Q12052 315 aa7.34□□□□□ -1.23
LPD1YFL018C MDY2Q12285 212 aa7.34□□□□□ -1.23
LPD1YFL018C YML003WP0CF16 290 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C PDA1P16387 420 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C SAM2P19358 384 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C COX13P32799 129 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C PRY2P36110 329 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C VRP1P37370 817 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ASC1P38011 319 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YHR122WP38829 231 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C PFS1P38872 237 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YER188WP40103 239 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C PEX31P53203 462 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C AAH1P53909 347 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CDC55Q00362 526 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C AAT1Q01802 451 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YKR011CQ02209 353 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C UPS3Q04006 179 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YOL114CQ12322 202 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C JLP1Q12358 412 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YPL247CQ12523 523 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C STT4P37297 1900 aa7.33□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C PPH21P23594 369 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C LSB5P25369 354 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YCR099CP25657 155 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C MRP17P28778 131 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C NTH1P32356 751 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C NTF2P33331 125 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ARP1P38696 384 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C HTD2P38790 280 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C GPI16P38875 610 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C SMB1P40018 196 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C FIR1P40020 876 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ICP55P40051 511 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YIL152WP40455 235 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C EMC5P40540 141 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C IME4P41833 600 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YJL171CP46992 396 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YGR079WP53249 370 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C DIA1P54005 336 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ARG7Q04728 441 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CSI2Q08054 341 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C COQ10Q08058 207 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CRT10Q08226 957 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YPL260WQ08977 551 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C SRL2Q12020 392 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RDL1Q12305 139 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C FRE6Q12473 712 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C SNF8Q12483 233 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C SRF1Q12516 437 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C SWI5P08153 709 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CDC42P19073 191 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C NUP1P20676 1076 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C AFT1P22149 690 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C VBA3P25594 458 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C STP22P25604 385 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ARE1P25628 610 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RIB5P38145 238 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C SRP68P38687 599 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C MPM1P40364 252 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C LYS12P40495 371 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YHC3P47040 408 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RSM23Q01163 450 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C MET14Q02196 202 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C AVO2Q04749 426 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CNL1Q06333 122 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C HEM25Q07534 307 aa7.32□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C FIG2P25653 1609 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C GDH1P07262 454 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C PUT1P09368 476 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ELO2P25358 347 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C OAC1P32332 324 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C CUE1P38428 203 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C URA8P38627 578 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C PRP39P39682 629 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YEL057CP39983 233 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YIL161WP40449 235 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ALK1P43633 760 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C EXG2P52911 562 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YML018CQ03730 393 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ERP1Q05359 219 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C ATG41Q12048 136 aa7.31□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RPS31P05759 152 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YPR170W-BP0C5R9 85 aa7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C TFS1P14306 219 aa7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data7.3□□□□□ -1.24not detected
LPD1YFL018C PRE8P23639 250 aa7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C YSC83P32792 385 aa7.3□□□□□ -1.24
LPD1YFL018C MGA1P53050 456 aa7.3□□□□□ -1.24
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