RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	PAC2	P39937	518 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YER076C	P40049	302 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	DFG10	P40526	253 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	PMT4	P46971	762 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	GOR1	P53839	350 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	ORM2	Q06144	216 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	NSL1	Q12143	216 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	ARP6	Q12509	438 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SWI1	P09547	1314 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SPS100	P13130	326 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	CAP2	P13517	287 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SLY1	P22213	666 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MAK32	P23060	363 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YCR007C	P25354	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	PCL5	P38794	229 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	BDH1	P39714	382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YJL043W	P47053	257 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YJR054W	P47114	497 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	NBP35	P52920	328 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	RCF2	P53721	224 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	ABF2	Q02486	183 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YPR127W	Q06494	345 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YLR126C	Q12288	251 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SFM1	Q12314	213 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	STH1	P32597	1359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	RAD50	P12753	1312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	BI2	P03873	423 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	ERD1	P16151	362 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	EXO70	P19658	623 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	PHO80	P20052	293 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YCR100C	P25606	316 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TCA17	P32613	152 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	UPS2	P35200	230 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YBP1	P38315	674 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	IRC18	P47056	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	UBC13	P52490	153 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YPS5	P53057	165 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YNR048W	P53740	393 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	FYV6	P53913	173 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	NUP49	Q02199	472 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	NUP100	Q02629	959 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	CCE1	Q03702	353 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	INM2	Q05533	292 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MFG1	Q07684	458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YPD1	Q07688	167 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YLR031W	Q07978	186 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	FCY22	Q12119	530 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YOR1	P53049	1477 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SAL1	D6W196	494 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	DBF2	P22204	572 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	COQ3	P27680	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TIP20	P33891	701 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	ARN1	P38731	627 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	WSC4	P38739	605 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SHC1	P39000	512 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	VPS52	P39904	641 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	KRE29	P40026	464 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YGR201C	P42936	225 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	GUF1	P46943	645 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MDV1	P47025	714 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	OST3	P48439	350 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	VHT1	P53241	593 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SHY1	P53266	389 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YMR166C	Q03829	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SWF1	Q04629	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YLR036C	Q07986	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YAP7	Q08182	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TAF10	Q12030	206 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TPO4	Q12256	659 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TFC7	Q12415	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	REP1	P03871	373 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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