RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS1	YDR247W	ATG18	P43601	500 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	APS3	P47064	194 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	GOR1	P53839	350 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YNL260C	P53846	198 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YNL234W	P53857	426 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YNL140C	P53910	189 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	NUP116	Q02630	1113 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	TRM82	Q03774	444 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	AIM36	Q03798	255 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ASR1	Q06834	288 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YLR112W	Q12130	139 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	PEX11	Q12462	236 aa		5	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YPR096C	O13587	100 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	HIP1	P06775	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	MER1	P16523	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	DAL81	P21657	970 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	MRPL3	P36516	390 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	HMT1	P38074	348 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YHR035W	P38769	630 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	BIG1	P38813	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	HPA3	P39979	161 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YIL089W	P40500	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YIR016W	P40572	265 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ERV29	P53337	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	FRE4	P53746	719 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	GPN3	Q06543	272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	FEX1	Q08913	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	FEX2	Q08991	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ATP14	Q12349	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SRN2	Q99176	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	MTR10	Q99189	972 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SPO23	P33757	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YGR201C	P42936	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ECM27	P47144	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RHO4	Q00246	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SCS7	Q03529	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	VHS1	Q03785	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	BUR2	Q05949	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ARV1	Q06541	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	PLB3	Q08108	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SFM1	Q12314	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SIR2	P06700	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	BAR1	P12630	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YCR102C	P25608	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	CPR3	P25719	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SOL2	P37262	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YBR063C	P38083	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RRF1	P38771	230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	FLO5	P38894	1075 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	FET3	P38993	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YEL073C	P39974	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	FMC1	P40491	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YFR018C	P43599	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YGR015C	P53208	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	TDA1	Q03533	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	EKI1	Q03764	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RIM13	Q03792	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	DCS1	Q06151	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	DCI1	Q08558	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	NDD1	Q08887	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	VAM3	Q12241	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	RGT2	Q12300	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	SFG1	Q12507	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VHS1	YDR247W	STT4	P37297	1900 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	HXT2	P23585	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	ATP11	P32453	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	PDR3	P33200	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VHS1	YDR247W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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