RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 PNMA5Q96PV4 448 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 CSRNP2Q9H175 543 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1468Q9P260 1216 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 V9GYY5 206 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQ27 194 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQ64 194 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQD8 194 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 CAND2O75155 1236 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 SMC2O95347 1197 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 RABGGTAQ92696 567 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 LRFN2Q9ULH4 789 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC34A2O95436 690 aa13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 BORCS6Q96GS4 357 aa13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 NACC1Q96RE7 527 aa13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 GBP3Q9H0R5 595 aa13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR182O15218 404 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 EDN1P05305 212 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 GRB10Q13322 594 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ZHX3Q9H4I2 956 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 INSL6Q9Y581 213 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 YEATS4O95619 227 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPAQ15257 358 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 SYCP1Q15431 976 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 HAUS3Q68CZ6 603 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ISM2Q6H9L7 571 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 BRAPQ7Z569 592 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CABP7Q86V35 215 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 IFNKQ9P0W0 207 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 DGAT1O75907 488 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF202O95125 648 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 TMC6Q7Z403 805 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 HELQQ8TDG4 1101 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF39Q9H2S5 420 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 TUFT1Q9NNX1 390 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 34.3
RABGEF1-209ENST00000607882 CTNNB1P35222 781 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 UBA7P41226 1012 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 GSDMDP57764 484 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 APBB2Q92870 758 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 DNM3Q9UQ16 869 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC169A6NNP5 214 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 C9IYK1 514 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 DGKIO75912 1065 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 PFKFB1P16118 471 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 PLCG1P19174 1290 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX3P56589 373 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 MCM6Q14566 821 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 EPC2Q52LR7 807 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB34Q9BZG1 259 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 RFC5P40937 340 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ATL2Q8NHH9 583 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 IKZF4Q9H2S9 585 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKEF1Q9NU02 776 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 KLK14Q9P0G3 267 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087X0B3 334 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 HIP1RO75146 1068 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ERLIN2O94905 339 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 AKAP5P24588 427 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 TFF2Q03403 129 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 PDIA5Q14554 519 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 DAW1Q8N136 415 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 FIBCD1Q8N539 461 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 LPXNO60711 386 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 LYPLA2O95372 231 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.216e-6■□□□□ 8.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL2P36404 184 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms