RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 SIP14410 1827 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WZ62 844 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KBTBD13C9JR72 458 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 K7ENM7 598 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DNM1LO00429 736 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 B4GALT5O43286 388 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZEB2O60315 1214 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 B4GALT4O60513 344 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MSCO60682 206 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SMC2O95347 1197 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL2P36404 184 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RFC5P40937 340 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GRM5P41594 1212 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NPTX2P47972 431 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF445P59923 1031 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM17P78536 824 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 AMPD3Q01432 767 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EHHADHQ08426 723 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 STX1AQ16623 288 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGISQ16647 500 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA20Q8TB22 786 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RBSNQ9H1K0 784 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPY26PQ9H489 355 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 AKT3Q9Y243 479 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.65□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.65□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CLIC2O15247 247 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KPNA6O60684 536 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOBTB3O94955 611 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PROCP04070 461 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 IQCF3P0C7M6 154 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PLS3P13797 630 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXC8P31273 242 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GJA8P48165 433 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC26A2P50443 739 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF131P52739 623 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNB1Q14721 858 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN21Q16825 1174 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KIZQ2M2Z5 673 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM60Q495X7 471 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SEZ6Q53EL9 994 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LUZP1Q86V48 1076 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF149Q8NC42 400 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DEPTORQ8TB45 409 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NELFBQ8WX92 580 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CPB2Q96IY4 423 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM84AQ96KN4 292 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SCLT1Q96NL6 688 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GSDMAQ96QA5 445 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 OSMRQ99650 979 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PARVGQ9HBI0 331 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CBX8Q9HC52 389 aa6.64□□□□□ -1.35
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