RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 LCHNA4D1U4 455 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 KLRC4O43908 158 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF15O94989 841 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF202O95125 648 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 COASYQ13057 564 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ZPBP2Q6X784 338 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 MSRAQ9UJ68 235 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CDH23Q9H251 3354 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 K7ENM7 598 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 HOXA2O43364 376 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CA3P07451 260 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 MYOGP15173 224 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CUL4BQ13620 913 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ALCAMQ13740 583 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TIFAQ96CG3 184 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TIGD1Q96MW7 591 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PANK4Q9NVE7 773 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.54■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CITO14578 2027 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 UPP2O95045 317 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ASIC1P78348 528 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TAP1Q03518 808 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 YME1L1Q96TA2 773 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TBX20Q9UMR3 447 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 IPPQ9Y573 584 aa20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 LINC01553A4QN01 128 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 IDEP14735 1019 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CASP1P29466 404 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 AFMP43652 599 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 UBE2HP62256 183 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PGBD4Q96DM1 585 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CASD1Q96PB1 797 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 USP20Q9Y2K6 914 aa20.52■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 TOM1L1O75674 476 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 FGFR1P11362 822 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 LIG1P18858 919 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 CASP5P51878 434 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 DPYDQ12882 1025 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 STRN3Q13033 797 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 KANK3Q6NY19 840 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 CDT1Q9H211 546 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 TRIP11Q15643 1979 aa20.51■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 NR1I2O75469 434 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 NPTXRO95502 500 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 PRR29P0C7W0 189 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 GATMP50440 423 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 ERVK-21P61565 698 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 MCL1Q07820 350 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 SPATA20Q8TB22 786 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.5■□□□□ 0.87
HDGFL2-201ENST00000587016 UBE4BO95155 1302 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms