RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 BIN1O00499 593 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 AXLP30530 894 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 GTF2BQ00403 316 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 STK4Q13043 487 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ALCAMQ13740 583 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 UBXN11Q5T124 520 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ISM2Q6H9L7 571 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 HVCN1Q96D96 273 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 CCDC51Q96ER9 411 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ACCSQ96QU6 501 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SLC9A7Q96T83 725 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 RGS18Q9NS28 235 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 UBE4BO95155 1302 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 COL4A6Q14031 1691 aa15.38■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 C9IYK1 514 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ENPP3O14638 875 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 RHOBTB3O94955 611 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 BMP8BP34820 402 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 GATMP50440 423 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 KCNB1Q14721 858 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SLC27A1Q6PCB7 646 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 LPPQ93052 612 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 CDT1Q9H211 546 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PRO3102Q9H379 93 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 CHST12Q9NRB3 414 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 RMND1Q9NWS8 449 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 HES2Q9Y543 173 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 TTC3P53804 2025 aa15.37■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 FGFR1P11362 822 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ABCD1P33897 745 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 RAB27AP51159 221 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 RABGGTBP53611 331 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 RASIP1Q5U651 963 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 CEP120Q8N960 986 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SCFD1Q8WVM8 642 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 TCHPQ9BT92 498 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 STRA6Q9BX79 667 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 TNFSF13BQ9Y275 285 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 IPPQ9Y573 584 aa15.36■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 A0A1B0GUA9 196 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SCP2P22307 547 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 OSTNP61366 133 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SEZ6Q53EL9 994 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ZPBP2Q6X784 338 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 GSDMAQ96QA5 445 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa15.35■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 A0A0U1RQF3 1178 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ABLIM1O14639 778 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 TOM1L1O75674 476 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PIGRP01833 764 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 STAG3L1P0CL83 205 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PTMSP20962 102 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PROZP22891 400 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 HOXD13P35453 343 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 PSMD2Q13200 908 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 THNSL1Q8IYQ7 743 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 POMGNT1Q8WZA1 660 aa15.34■□□□□ 0.05
GGA3-216ENST00000583282 KCNN1Q92952 543 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms