RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553732.1

TGFB3-AS1-201, TGFB3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TGFB3-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.69□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RSAD1Q9HA92 442 aa8.69□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.69□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.69□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.69□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LAMA4Q16363 1823 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAN2B1O00754 1011 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCL16O15467 120 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RAB27AP51159 221 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LIMK1P53667 647 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CDC42EP1Q00587 391 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SATB1Q01826 763 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LIN9Q5TKA1 542 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LILRA6Q6PI73 481 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAP4K1Q92918 833 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KIF12Q96FN5 646 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM167AQ96KS9 214 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CHRDQ9H2X0 955 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LY9Q9HBG7 655 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MARCH5Q9NX47 278 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.68□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 XYLBO75191 536 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PAPLNO95428 1278 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C1RP00736 705 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CNR2P34972 360 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DNM2P50570 870 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DRP2Q13474 957 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 USP41Q3LFD5 358 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LONP2Q86WA8 852 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ING5Q8WYH8 240 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM3CQ92520 227 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ANO3Q9BYT9 981 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 BRD9Q9H8M2 597 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.67□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM86B1E9PN63 330 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 F8W810 466 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GIPC1O14908 333 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TADA2AO75478 443 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ECI2O75521 394 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OATP04181 439 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C8AP07357 584 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF806P0C7X5 589 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ITGA4P13612 1032 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RXRAP19793 462 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MTERF2Q49AM1 385 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RNF43Q68DV7 783 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KSR1Q8IVT5 923 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NCOA7Q8NI08 942 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NLRP4Q96MN2 994 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAP3K14Q99558 947 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IER2Q9BTL4 223 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CHST7Q9NS84 486 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FNIP2Q9P278 1114 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.66□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.65□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC69A6NI79 296 aa8.65□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SHISA7A6NL88 538 aa8.65□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HIP1O00291 1037 aa8.65□□□□□ -1.02
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF862O60290 1169 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms