RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 CTDNEP1O95476 244 aa22.18■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 KLRC2P26717 231 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 AXLP30530 894 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.18■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 TSPAN1O60635 241 aa22.17■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 POU5F1BQ06416 359 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 DSC1Q08554 894 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 RNF39Q9H2S5 420 aa22.16■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 ARL5CA6NH57 179 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 PROB1E7EW31 1015 aa22.15■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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NELFE-212ENST00000492539 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.12■■□□□ 1.13
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