RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGLV2-14	P01704	120 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	TLK1	Q9UKI8	766 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123		H7C1D1	291 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPDEF	O95238	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	MATN4	O95460	622 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC9A1	P19634	815 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	NHLH1	Q02575	133 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF174	Q15697	407 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	POFUT1	Q9H488	388 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	RNF7	Q9UBF6	113 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	MARCH11	A6NNE9	402 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	LY86	O95711	162 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	RASA3	Q14644	834 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	C7orf31	Q8N865	590 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	CAGE1	Q8TC20	777 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPON1	Q9HCB6	807 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	MPP3	Q13368	585 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	JMY	Q8N9B5	988 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC9A6	Q92581	669 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	MAST3	O60307	1309 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	C1QL1	O75973	258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	METRNL	Q641Q3	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SUCLG1-208	ENST00000491123	MYPN	Q86TC9	1320 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDH8	O95206	1070 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	DUSP2	Q05923	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SCAP	Q12770	1279 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	REST	Q13127	1097 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKS6	Q68DC2	871 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF384	Q8TF68	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	DUSP26	Q9BV47	211 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123		B4E1Z4	1266 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	HLA-DOA	P06340	250 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SERINC3	Q13530	473 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	CABP5	Q9NP86	173 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	MGST3	O14880	152 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ITGAM	P11215	1152 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGFALS	P35858	605 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	NEU1	Q99519	415 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	DNAJC7	Q99615	494 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZMYM3	Q14202	1370 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPATA31D3	P0C874	917 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	RBP3	P10745	1247 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	CTGF	P29279	349 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ABCG1	P45844	678 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	DDB1	Q16531	1140 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZMAT4	Q9H898	229 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SUCLG1-208	ENST00000491123	RNF181	Q9P0P0	153 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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