RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM175Q9BSA9 504 aa30.86■■■□□ 2.53
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HOXB3-211ENST00000490677 CDH22Q9UJ99 828 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC27A1Q6PCB7 646 aa30.81■■■□□ 2.52
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HOXB3-211ENST00000490677 CNPP09543 421 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
HOXB3-211ENST00000490677 PLA2G5P39877 138 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXB3-211ENST00000490677 ITIH3Q06033 890 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXB3-211ENST00000490677 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
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