RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TBK1Q9UHD2 729 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 RPA1P27694 616 aa18.14■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SLCO1A2P46721 670 aa18.14■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.14■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 SLC1A1P43005 524 aa18.14■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.14■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 IFT43Q96FT9 208 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 RALAP11233 206 aa18.12■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 ADORA2BP29275 332 aa18.12■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 WDR72Q3MJ13 1102 aa18.11■□□□□ 0.49
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NISCH-213ENST00000489895 ERAP1Q9NZ08 941 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 CHGBP05060 677 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 PRKCEQ02156 737 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-213ENST00000489895 TROAPQ12815 778 aa18.11■□□□□ 0.49
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