RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 FOXL1Q12952 345 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MALLQ13021 153 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 GPR156Q8NFN8 814 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ZNF480Q8WV37 535 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 ADI1Q9BV57 179 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 KLC2Q9H0B6 622 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 TLR9Q9NR96 1032 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-204ENST00000487939 CYP27B1O15528 508 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 AKR1B10O60218 316 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ADAM17P78536 824 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 EDAQ92838 391 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 IL17RAQ96F46 866 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 CEP89Q96ST8 783 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MUSKO15146 869 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ZNF20P17024 532 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 CCND1P24385 295 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ECHS1P30084 290 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 CRHR1P34998 444 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 CASRP41180 1078 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 GZMKP49863 264 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ACAP2Q15057 778 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MST1LQ2TV78 715 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 BORCS6Q96GS4 357 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ADOQ96SZ5 270 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 EPC1Q9H2F5 836 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 SCOCQ9UIL1 159 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 CAPN14A8MX76 684 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ADRB1P08588 477 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 GNAT2P19087 354 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MCAMP43121 646 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 PTPN21Q16825 1174 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MIEF2Q96C03 454 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 BCO1Q9HAY6 547 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MFAP3LO75121 409 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ITGA10O75578 1167 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ENDOD1O94919 500 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 SLC16A1P53985 500 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MGAT2Q10469 447 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 Q6ZSN1 163 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 OR7D4Q8NG98 312 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 JADE3Q92613 823 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 GPR20Q99678 358 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 DNM3Q9UQ16 869 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.93□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 APBA1Q02410 837 aa5.92□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 NOMO1Q15155 1222 aa5.92□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
PTEN-204ENST00000487939 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms