RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 POMKQ9H5K3 350 aa23.94■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.94■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.94■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 IRAK3Q9Y616 596 aa23.94■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.94■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 PLXNA3P51805 1871 aa23.94■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 NRP1O14786 923 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 AXLP30530 894 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 SCNN1GP51170 649 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 POTEGQ6S5H5 508 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 CCDC51Q96ER9 411 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.93■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 TMEM221A6NGB7 291 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 ARL5CA6NH57 179 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 M0R296 226 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 ALDH2P05091 517 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 OR52Z1P0C646 297 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 MARCH5Q9NX47 278 aa23.92■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 F8W810 466 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 NPTXRO95502 500 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 OR1G1P47890 313 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 ITIH3Q06033 890 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 POU5F1BQ06416 359 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 GIT2Q14161 759 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 NBR1Q14596 966 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 TTC38Q5R3I4 469 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 KIF2CQ99661 725 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 MIOSQ9NXC5 875 aa23.91■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 C2CD2LO14523 706 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 AKAP5P24588 427 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 PTPN21Q16825 1174 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 ZBTB33Q86T24 672 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.9■■□□□ 1.42
USP40-215ENST00000484528 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 KLRC2P26717 231 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 MTHFRP42898 656 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 CABP7Q86V35 215 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 ERMNQ8TAM6 284 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 FBXL18Q96ME1 805 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 NACC1Q96RE7 527 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 KLK14Q9P0G3 267 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 NR2E1Q9Y466 385 aa23.89■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 INPPL1O15357 1258 aa23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 DSC1Q08554 894 aa23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 C8orf34Q49A92 452 aa23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 BSNDQ8WZ55 320 aa23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 SOD2P04179 222 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 URODP06132 367 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 LIG1P18858 919 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 RPA1P27694 616 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 SIGLEC14Q08ET2 396 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 PADI6Q6TGC4 694 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 HACE1Q8IYU2 909 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 RABGGTAQ92696 567 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.87■■□□□ 1.41
USP40-215ENST00000484528 POLD4Q9HCU8 107 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms