RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 TTI2Q6NXR4 508 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 FAM228AQ86W67 206 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 CLDN3O15551 220 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 GNA14O95837 355 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 CXCL10P02778 98 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 MCF2P10911 925 aa14.26□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 PROZP22891 400 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 TPM4P67936 248 aa14.26□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 KCNA1Q09470 495 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 SPATA1Q5VX52 437 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 CEP63Q96MT8 703 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.26□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 PADI3Q9ULW8 664 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 BECN2A8MW95 431 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 CETN3O15182 167 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 NR3C1P04150 777 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 GHRP10912 638 aa14.25□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 RAG1P15918 1043 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 RAB27AP51159 221 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 ENPEPQ07075 957 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.25□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.25□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 TMEM199Q8N511 208 aa14.25□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 CD52P31358 61 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.24□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.24□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 TCHPQ9BT92 498 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 THAP9Q9H5L6 903 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.24□□□□□ -0.13
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NISCH-208ENST00000481211 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 ABLIM1O14639 778 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 OGTO15294 1046 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 B4GALT5O43286 388 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 EXTL3O43909 919 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 EVI5O60447 810 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 NBNO60934 754 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 EFCAB14O75071 495 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 EDN1P05305 212 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 ADSSP30520 456 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-208ENST00000481211 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
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