RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 SELPP16109 830 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 SYN1P17600 705 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 FSHRP23945 695 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGB8P26012 769 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 GPC3P51654 580 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ASIC1P78348 528 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 AMPD3Q01432 767 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 MGAT3Q09327 533 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 BFSP2Q13515 415 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CAPSQ13938 189 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM26DQ5JW98 314 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 RPAINQ86UA6 219 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 MYCT1Q8N699 235 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CAGE1Q8TC20 777 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAM32Q8TC27 787 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 KIFAP3Q92845 792 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 SCLYQ96I15 445 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 DRC1Q96MC2 740 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 SCLT1Q96NL6 688 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 OSMRQ99650 979 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TIPINQ9BVW5 301 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM9Q9C026 710 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 LTBP2Q14767 1821 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC169A6NNP5 214 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 M0QZ92 97 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ASAP2O43150 1006 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 KINO60870 393 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CAND2O75155 1236 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TIMP1P01033 207 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 IQCF3P0C7M6 154 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PLS3P13797 630 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 RAG1P15918 1043 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 FGFR4P22455 802 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX3P56589 373 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 RBL2Q08999 1139 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PNOCQ13519 176 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 MBTPS1Q14703 1052 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CAMK4Q16566 473 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 KANK3Q6NY19 840 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 SFR1Q86XK3 245 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF149Q8NC42 400 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 HPS3Q969F9 1004 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 IFT74Q96LB3 600 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TIGD1Q96MW7 591 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PANK4Q9NVE7 773 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC16A4O15374 487 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 KLRC4O43908 158 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 GHRP10912 638 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 NAMPTP43490 491 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 NPTX2P47972 431 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 RGS19P49795 217 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF131P52739 623 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 DPYDQ12882 1025 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 COASYQ13057 564 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TFDP1Q14186 410 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 GPNMBQ14956 572 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 POSTNQ15063 836 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ODR4Q5SWX8 454 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 UNC13DQ70J99 1090 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 DEPTORQ8TB45 409 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 BADQ92934 168 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PARVGQ9HBI0 331 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 CEP290O15078 2479 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-208ENST00000463533 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAK2O60296 914 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 NBNO60934 754 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.2 ms