RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP38Q8NB14 1042 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 TISP43B9A030 160 aa18.52■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN3O15551 220 aa18.52■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.52■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.52■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.52■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa18.52■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNJ18B7U540 433 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 PITPNM1O00562 1244 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPK13O15264 365 aa18.51■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP2J2P51589 502 aa18.51■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNJ12Q14500 433 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCP11X2Q5H9J9 407 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.51■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.51■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 N4BP3O15049 544 aa18.5■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS6KA5O75582 802 aa18.5■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.5■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP135Q66GS9 1140 aa18.5■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL18Q96ME1 805 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.5■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 USP20Q9Y2K6 914 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP3O75969 853 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 SELPP16109 830 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGFR4P22455 802 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 TLE2Q04725 743 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAAP100Q0VG06 881 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOTUMQ6P988 496 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPD1LQ8N335 351 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC51Q96ER9 411 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABLIM1O14639 778 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXTL3O43909 919 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINC1P01008 464 aa18.48■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MCF2P10911 925 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KYAT1Q16773 422 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM228AQ86W67 206 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM186BQ8IYM0 893 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHST12Q9NRB3 414 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.48■□□□□ 0.55
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