RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395198.7

HERC4-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-204ENST00000395198 LSMEM2Q8N112 164 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 AK8Q96MA6 479 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 TCF25Q9BQ70 676 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.6□□□□□ -1.67
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HERC4-204ENST00000395198 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.59□□□□□ -1.67
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HERC4-204ENST00000395198 CAVIN2O95810 425 aa4.59□□□□□ -1.67
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HERC4-204ENST00000395198 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.59□□□□□ -1.67
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HERC4-204ENST00000395198 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 NCLNQ969V3 563 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 SLC47A1Q96FL8 570 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 SPATA17Q96L03 361 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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HERC4-204ENST00000395198 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.59□□□□□ -1.67
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HERC4-204ENST00000395198 E7EVH7 732 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 MEN1O00255 615 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 ENC1O14682 589 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC4-204ENST00000395198 BACH1O14867 736 aa4.59□□□□□ -1.67
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HERC4-204ENST00000395198 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 9.1
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HERC4-204ENST00000395198 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.59□□□□□ -1.68
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HERC4-204ENST00000395198 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
HERC4-204ENST00000395198 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.59□□□□□ -1.68
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HERC4-204ENST00000395198 GPT2Q8TD30 523 aa4.59□□□□□ -1.68
HERC4-204ENST00000395198 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.59□□□□□ -1.68
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