RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.77■■□□□ 1.88
ECHDC3-201ENST00000379215 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CLDN3O15551 220 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 FIGNQ5HY92 759 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CNGA4Q8IV77 575 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ARRDC4Q8NCT1 418 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A0B4J269 797 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 TREHO43280 583 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MSTO1Q9BUK6 570 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF233A6NK53 670 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 VAMP7P51809 220 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 LHX8Q68G74 356 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 RSPH3Q86UC2 560 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 RDH13Q8NBN7 331 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 SAAL1Q96ER3 474 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC51Q96ER9 411 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa26.75■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.74■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 TMC2Q8TDI7 906 aa26.74■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.74■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.74■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.74■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ERLIN2O94905 339 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ACLYP53396 1101 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MCL1Q07820 350 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CETN1Q12798 172 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPN21Q16825 1174 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 GLT1D1Q96MS3 346 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 TCHPQ9BT92 498 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 EVPLQ92817 2033 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 P4HA2O15460 535 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR32O75388 356 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 GYPCP04921 128 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 PROZP22891 400 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 HIC1Q14526 733 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM47CQ5HY64 1035 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CBWD2Q8IUF1 395 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM213AQ9BRX8 229 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 EDEM3Q9BZQ6 932 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A1W2PQJ5 194 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA8IPA6NC78 632 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA8JA6NMD2 632 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 M0QZ92 97 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 EDN1P05305 212 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CYP24A1Q07973 514 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 RBL2Q08999 1139 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 KIZQ2M2Z5 673 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 GBP6Q6ZN66 633 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 PMM2O15305 246 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 MFAP3LO75121 409 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 GTF2H1P32780 548 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 FMO5P49326 533 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 KYAT1Q16773 422 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 RPAINQ86UA6 219 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 NEK11Q8NG66 645 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 PPP1R16BQ96T49 567 aa26.71■■□□□ 1.87
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ECHDC3-201ENST00000379215 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
ECHDC3-201ENST00000379215 OGTO15294 1046 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 ADRB2P07550 413 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 AMHR2Q16671 573 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF568Q3ZCX4 644 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 PANX2Q96RD6 677 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHDC3-201ENST00000379215 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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