RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 STAG3L1P0CL83 205 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 CASP5P51878 434 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ZPBP2Q6X784 338 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ACCSQ96QU6 501 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TRAIPQ9BWF2 469 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PDZD7Q9H5P4 517 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.37■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 A0A0U1RQF3 1178 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PPP1R37O75864 691 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 LIG4P49917 911 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 KCNB1Q14721 858 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 NPAS4Q8IUM7 802 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 MAP4K3Q8IVH8 894 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TCHPQ9BT92 498 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ZBED2Q9BTP6 218 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TNFSF13BQ9Y275 285 aa28.36■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 CAMK4Q16566 473 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ECHDC2Q86YB7 292 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 SYCP3Q8IZU3 236 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 RNF169Q8NCN4 708 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 GPT2Q8TD30 523 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TOP1MTQ969P6 601 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 GSDMAQ96QA5 445 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 STRA6Q9BX79 667 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa28.35■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 RHOBTB3O94955 611 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 NPTXRO95502 500 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 FAM189BP81408 668 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 UBXN11Q5T124 520 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 HERC6Q8IVU3 1022 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 HACE1Q8IYU2 909 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TMEM206Q9H813 350 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TMEM161AQ9NX61 479 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa28.34■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TOM1L1O75674 476 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 GLIS3Q8NEA6 775 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 CLSTN2Q9H4D0 955 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 UBE4BO95155 1302 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 EOMESO95936 686 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PIGRP01833 764 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PTMSP20962 102 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 STK4Q13043 487 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 EEF1DP3Q658K8 133 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 MPZL3Q6UWV2 235 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 PGBD4Q96DM1 585 aa28.33■■■□□ 2.13
GKAP1-202ENST00000376365 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF623O75123 536 aa28.32■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 GJB5O95377 273 aa28.32■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ZBTB33Q86T24 672 aa28.32■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 GBF1Q92538 1859 aa28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 CLDN3O15551 220 aa28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 KCNA1Q09470 495 aa28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA0895Q8NCT3 520 aa28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 SPATA20Q8TB22 786 aa28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF507Q8TCN5 953 aa28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 IPPQ9Y573 584 aa28.31■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 SCFD1Q8WVM8 642 aa28.3■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 YME1L1Q96TA2 773 aa28.3■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 PTPRHQ9HD43 1115 aa28.3■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 HOXA2O43364 376 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 TLL1O43897 1013 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 KIF20AO95235 890 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 MCF2P10911 925 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ITGA4P13612 1032 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 PROZP22891 400 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 SLFN12LQ6IEE8 588 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ABI1Q8IZP0 508 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 APOL6Q9BWW8 343 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 CDT1Q9H211 546 aa28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
GKAP1-202ENST00000376365 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms