RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 VPS11Q9H270 941 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 BRAFP15056 766 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 EXT2Q93063 718 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5HO75947 161 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ6P48051 423 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FSCBQ5H9T9 825 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRUQ92729 1446 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FAM205CA6NFA0 338 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KRT14P02533 472 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KIF12Q96FN5 646 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB18Q99592 522 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 URGCPQ8TCY9 931 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R2AP63151 447 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TAF11Q15544 211 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KCND2Q9NZV8 630 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SLC18A3Q16572 532 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 GIPC2Q8TF65 315 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 IFT43Q96FT9 208 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SCP2P22307 547 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 COPS2P61201 443 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 DPYDQ12882 1025 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 DPF2Q92785 391 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TNIP3Q96KP6 325 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SCOCQ9UIL1 159 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SRGNP10124 158 aa21.52■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SNF8Q96H20 258 aa21.52■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.52■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 POLIQ9UNA4 740 aa21.52■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRB3O60242 1522 aa21.52■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 GYG2O15488 501 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 RTN2O75298 545 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SLC1A1P43005 524 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 GYS2P54840 703 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ROR1Q01973 937 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CDC26Q8NHZ8 85 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 STK33Q9BYT3 514 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ASAP2O43150 1006 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CDH6P55285 790 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 DRP2Q13474 957 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR2Q13614 643 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ACAD11Q709F0 780 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CYP26A1O43174 497 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MTF1Q14872 753 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 GMNCA6NCL1 334 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf81C9J6K1 198 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 H3BRJ5 948 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCBP05771 671 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNA5P30532 468 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PEX19P40855 299 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC43Q8N309 656 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K14Q99558 947 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SNX12Q9UMY4 172 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 UNC13BO14795 1591 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 KIF19Q2TAC6 998 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 HPS3Q969F9 1004 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TTC8Q8TAM2 541 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 RASA1P20936 1047 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ADORA2BP29275 332 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 IZUMO3Q5VZ72 239 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms