RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 MS4A14Q96JA4 679 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 TLK1Q9UKI8 766 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ELP3Q9H9T3 547 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 GGPS1O95749 300 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 SCP2P22307 547 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 SDC4P31431 198 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ACOT2P49753 483 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 TOM1L1O75674 476 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 PKN1Q16512 942 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ASB14A6NK59 587 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 PRKCBP05771 671 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 BCL9O00512 1426 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 KRT7P08729 469 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 IRX4P78413 519 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 HDAC11Q96DB2 347 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 RASA4BC9J798 803 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 MSH4O15457 936 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 RASA4O43374 803 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF6Q15052 776 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 MCUQ8NE86 351 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 TKFCQ3LXA3 575 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NISCH-201ENST00000345716 NAB2Q15742 525 aa22.08■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.08■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 PARVAQ9NVD7 372 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 MYOM1P52179 1685 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 KRT37O76014 449 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 DPEP1P16444 411 aa22.07■■□□□ 1.12
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NISCH-201ENST00000345716 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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NISCH-201ENST00000345716 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 DCLK2Q8N568 766 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 CYP11B2P19099 503 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 MMEL1Q495T6 779 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 KRT14P02533 472 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 SEPT6Q14141 434 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 SPARCL1Q14515 664 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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NISCH-201ENST00000345716 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 GPS1Q13098 491 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 TTC39CQ8N584 583 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 ACER1Q8TDN7 264 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 TTC25Q96NG3 672 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R2AP63151 447 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 PRKCEQ02156 737 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 KIF12Q96FN5 646 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 EMC2Q15006 297 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NISCH-201ENST00000345716 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.05■■□□□ 1.12
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