RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.58■□□□□ 0.25
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PTPRU-201ENST00000345512 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 HAS1Q92839 578 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 SMIM24O75264 130 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 ITIH2P19823 946 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 RAD17O75943 681 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 SCINQ9Y6U3 715 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TRAPPC3O43617 180 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TLR2O60603 784 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GPS1Q13098 491 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CD302Q8IX05 232 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GINM1Q9NU53 330 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CES2O00748 559 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 EPC2Q52LR7 807 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PDIK1LQ8N165 341 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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