RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FZD1Q9UP38 647 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 DENND3A2RUS2 1198 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 MAFGO15525 162 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CHRNB2P17787 502 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CNGA1P29973 690 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.189e-7■■■■■ 60.2
KCNQ1-202ENST00000335475 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM170AA1A519 330 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 KRIT1O00522 736 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 OPA1O60313 960 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 GUCY2FP51841 1108 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 KIFAP3Q92845 792 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ARL8AQ96BM9 186 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP2A1O14983 1001 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 NFASCO94856 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SIP14410 1827 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SMTNP53814 917 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PPFIA1Q13136 1202 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SHC3Q92529 594 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP170P1Q96L14 293 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CARD9Q9H257 536 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PICK1Q9NRD5 415 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SGPL1O95470 568 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CUL1Q13616 776 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC31Q6UY01 552 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 HELQQ8TDG4 1101 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TMC2Q8TDI7 906 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF233A6NK53 670 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 GPC3P51654 580 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT39Q6A163 491 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CD302Q8IX05 232 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 SEC14L1Q92503 715 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ALG3Q92685 438 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 RUFY1Q96T51 708 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 NR2E1Q9Y466 385 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 FGGP02679 453 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 RTP1P59025 263 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 AMACRQ9UHK6 382 aa22.4■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PRKCEQ02156 737 aa22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP24A1Q07973 514 aa22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP58Q5T655 872 aa22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
KCNQ1-202ENST00000335475 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 96.1
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRFP10586 1907 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 C19orf81C9J6K1 198 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 RTN2O75298 545 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 MTA2O94776 668 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 PSAPP07602 524 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 FMO1Q01740 532 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms