RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 PBX4Q9BYU1 374 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 TNFSF13BQ9Y275 285 aa29.4■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 HOXA2O43364 376 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 NR1I2O75469 434 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 DGKIO75912 1065 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 CASP1P29466 404 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZPBP2Q6X784 338 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 YME1L1Q96TA2 773 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 PDZD7Q9H5P4 517 aa29.39■■■□□ 2.3
CRIP1-201ENST00000330233 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 TTLL13PA6NNM8 815 aa29.38■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 HACE1Q8IYU2 909 aa29.38■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 STRA6Q9BX79 667 aa29.38■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 KINO60870 393 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 GCNT3O95395 438 aa29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 EDN1P05305 212 aa29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 PSMD2Q13200 908 aa29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 RSPH1Q8WYR4 309 aa29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 USP20Q9Y2K6 914 aa29.37■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 NPTXRO95502 500 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJB2P25686 324 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 EHHADHQ08426 723 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 DPYDQ12882 1025 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 POSTNQ15063 836 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 RNF169Q8NCN4 708 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 BICD1Q96G01 975 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 TCHPQ9BT92 498 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 UBN1Q9NPG3 1134 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 EXOC7Q9UPT5 735 aa29.36■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 KLRC4O43908 158 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 TOM1L1O75674 476 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R37O75864 691 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 PIGRP01833 764 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 RPN1P04843 607 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 PBX2P40425 430 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 FAM26FQ5R3K3 315 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 MAP4K3Q8IVH8 894 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 ACCSQ96QU6 501 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRHQ9HD43 1115 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 EXOC1Q9NV70 894 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 IPPQ9Y573 584 aa29.35■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 ITGA4P13612 1032 aa29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 LIG4P49917 911 aa29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 ABI1Q8IZP0 508 aa29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 TIFAQ96CG3 184 aa29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 SLC28A3Q9HAS3 691 aa29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 LMBRD1Q9NUN5 540 aa29.34■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 PRR29P0C7W0 189 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 MYOGP15173 224 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 PROZP22891 400 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 EEF1DP3Q658K8 133 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 GPR153Q6NV75 609 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 MPZL3Q6UWV2 235 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM117Q9H0C3 514 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM206Q9H813 350 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 MYO9BQ13459 2157 aa29.33■■■□□ 2.29
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN3O15551 220 aa29.32■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 MYBP10242 640 aa29.32■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 FGFR1P11362 822 aa29.32■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa29.32■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 SMC2O95347 1197 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CA3P07451 260 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 MCF2P10911 925 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 CASP5P51878 434 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 KCNB1Q14721 858 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF568Q3ZCX4 644 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 SLFN12LQ6IEE8 588 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 FIBCD1Q8N539 461 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 LPPQ93052 612 aa29.31■■■□□ 2.28
CRIP1-201ENST00000330233 HPS3Q969F9 1004 aa29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms