RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 GPR88Q9GZN0 384 aa23.24■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 FBXO40Q9UH90 709 aa23.24■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.24■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 LRRN2O75325 713 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CNPY4Q8N129 248 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 LMO3Q8TAP4 145 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 MAF1Q9H063 256 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 PRLRP16471 622 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CNGA1P29973 690 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 GGCXP38435 758 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 EHD2Q9NZN4 543 aa23.23■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA6CA6NDK9 693 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 PPATQ06203 517 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CETN1Q12798 172 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CDCA5Q96FF9 252 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ANXA13P27216 316 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ICAM3P32942 547 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 XKR3Q5GH77 459 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 HVCN1Q96D96 273 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ZNF302Q9NR11 478 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.22■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CCDC181Q5TID7 509 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ERO1BQ86YB8 467 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 SUFUQ9UMX1 484 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 FAM170AA1A519 330 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 BCAS4Q8TDM0 211 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 NENFQ9UMX5 172 aa23.21■■□□□ 1.31
MESP1-201ENST00000300057 MAPK13O15264 365 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 ATP4AP20648 1035 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 NF2P35240 595 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 MXI1P50539 228 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 EPC2Q52LR7 807 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 IFT74Q96LB3 600 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 A6NNZ2 444 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 EMC2Q15006 297 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 BICD1Q96G01 975 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 SYT17Q9BSW7 474 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 TSKSQ9UJT2 592 aa23.2■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 P4HA2O15460 535 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 OATP04181 439 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 H2AFZP0C0S5 128 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 H2AFVQ71UI9 128 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 TMEM143Q96AN5 459 aa23.19■■□□□ 1.3
MESP1-201ENST00000300057 CABS1Q96KC9 395 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms