RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 PPIL2Q13356 520 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 LLGL1Q15334 1064 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 C2CD6Q53TS8 623 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 RABGGTAQ92696 567 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 TCHPQ9BT92 498 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 MYPNQ86TC9 1320 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 K7ERI5 159 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PDHXO00330 501 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SASH3O75995 380 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 TNNI1P19237 187 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 DEPTORQ8TB45 409 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 STK33Q9BYT3 514 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SNX12Q9UMY4 172 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 NFASCO94856 1347 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 UBE4BO95155 1302 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CYP26A1O43174 497 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 GALCP54803 685 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PPP2R5AQ15172 486 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CCL15Q16663 113 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CREG2Q8IUH2 290 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 AZI2Q9H6S1 392 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 RRAGCQ9HB90 399 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 TRPC6Q9Y210 931 aa11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SGPL1O95470 568 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 OSBPP22059 807 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 NAB2Q15742 525 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CCDC181Q5TID7 509 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SV2AQ7L0J3 742 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SLC47A2Q86VL8 602 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 RDM1Q8NG50 284 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 NLRP4Q96MN2 994 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 ABCB6Q9NP58 842 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 EXOC7Q9UPT5 735 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 HTTP42858 3142 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 BTBD19C9JJ37 291 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SNAPC2Q13487 334 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 BIRC3Q13489 604 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 RHPN2Q8IUC4 686 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 KREMEN1Q96MU8 473 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PTPRJQ12913 1337 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 TNFAIP3P21580 790 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CLCN3P51790 818 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CETN1Q12798 172 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 STRN3Q13033 797 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 RNF149Q8NC42 400 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 ZNF516Q92618 1163 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 OTOFQ9HC10 1997 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 LCTP09848 1927 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PTPRFP10586 1907 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 KCNK3O14649 394 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 PJA2O43164 708 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CELF2O95319 508 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 KRT5P13647 590 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 EDNRBP24530 442 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 ICAM3P32942 547 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 TNFSF9P41273 254 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 CAPSQ13938 189 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 NEDD9Q14511 834 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 NFIL3Q16649 462 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 METTL7BQ6UX53 244 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 THAP2Q9H0W7 228 aa10.99□□□□□ -0.65
PSME3-201ENST00000293362 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms