RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264839.11

RIMS1-201, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RIMS1, Length 7,055 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-201ENST00000264839 P3H1Q32P28 736 aa13.4□□□□□ -0.26
RIMS1-201ENST00000264839 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.4□□□□□ -0.26
RIMS1-201ENST00000264839 SIK2Q9H0K1 926 aa13.4□□□□□ -0.26
RIMS1-201ENST00000264839 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RIMS1-201ENST00000264839 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.4□□□□□ -0.26
RIMS1-201ENST00000264839 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RIMS1-201ENST00000264839 ARHGEF10O15013 1369 aa13.4□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ADORA2BP29275 332 aa13.4□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RHOT2Q8IXI1 618 aa13.4□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ZBTB18Q99592 522 aa13.4□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TYK2P29597 1187 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 FBXW4P57775 412 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RNF139Q8WU17 664 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RAD51CO43502 376 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TBCCQ15814 346 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DPP9Q86TI2 863 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 OLFM3Q96PB7 478 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 M0QYV0 167 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CFAP73A6NFT4 308 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CCND2P30279 289 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 HIF1AQ16665 826 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PLD3Q8IV08 490 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CLEC4FQ8N1N0 589 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 IFT43Q96FT9 208 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ARHGAP10A1A4S6 786 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF233A6NK53 670 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 GNA15P30679 374 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TFDP1Q14186 410 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 UNC13DQ70J99 1090 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 USP33Q8TEY7 942 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RAD54LQ92698 747 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 EGFL8Q99944 293 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TSSK1BQ9BXA7 367 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RUBCNLQ9H714 662 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 COPRSQ9NQ92 184 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 OLFML3Q9NRN5 406 aa13.39□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 WDR47O94967 919 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BMP3P12645 472 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SMARCA1P28370 1054 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DMPKQ09013 629 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 LRRC31Q6UY01 552 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SLC35G2Q8TBE7 412 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PCDHA6Q9UN73 950 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ADGRA2Q96PE1 1338 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KCNN4O15554 427 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PYGBP11216 843 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TRIP10Q15642 601 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CRKLP46109 303 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ROR1Q01973 937 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 LVRNQ6Q4G3 990 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TPST1O60507 370 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 FUT11Q495W5 492 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SCN4BQ8IWT1 228 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 OR6P1Q8NGX9 317 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DNAJC9Q8WXX5 260 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ATP6V0A1Q93050 837 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 EME1Q96AY2 570 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CAND2O75155 1236 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KRT38O76015 456 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TDP2O95551 362 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 AKR1B1P15121 316 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 MED21Q13503 144 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 METTL23Q86XA0 190 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 VAMP7P51809 220 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 LRRC74AQ0VAA2 488 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PNKPQ96T60 521 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 HAO1Q9UJM8 370 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 USP17L10C9JJH3 530 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 E5RI56 91 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms