RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 LPAR1Q92633 364 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TTC25Q96NG3 672 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CFAP73A6NFT4 308 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ECM1Q16610 540 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TTMPQ5BVD1 217 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GPD1LQ8N335 351 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TMX2Q9Y320 296 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ALG6Q9Y672 507 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RREB1Q92766 1687 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RASSF10A6NK89 507 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RSPH10BP0C881 870 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 NFIAQ12857 509 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MAPK7Q13164 816 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SCFD2Q8WU76 684 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MIS12Q9H081 205 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A4O15374 487 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CASP4P49662 377 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 AP3M2P53677 418 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PSMC6P62333 389 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GTF3C4Q9UKN8 822 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 FAM86B1E9PN63 330 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-9P63128 1117 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 KIF22Q14807 665 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ASTN1O14525 1302 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CENPCQ03188 943 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GJB7Q6PEY0 223 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PPCSQ9HAB8 311 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GUL6 1792 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 STAM2O75886 525 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SLITRK3O94933 977 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 KRT15P19012 456 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 LGSNQ5TDP6 509 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MAFGO15525 162 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TLR2O60603 784 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 P4HA1P13674 534 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MMP14P50281 582 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ARSHQ5FYA8 562 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 VSIG1Q86XK7 387 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MGARPQ8TDB4 240 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TMC2Q8TDI7 906 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CENPTQ96BT3 561 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 THAP2Q9H0W7 228 aa9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 DENND3A2RUS2 1198 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms