RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 ERVK-9P63128 1117 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 KRT39Q6A163 491 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CAGE1Q8TC20 777 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 SEMA4DQ92854 862 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 BICD1Q96G01 975 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 INTUQ9ULD6 942 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 H2AFZP0C0S5 128 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CXCR5P32302 372 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 H2AFVQ71UI9 128 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 MORC4Q8TE76 937 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 PSMB7Q99436 277 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 TSKSQ9UJT2 592 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 FTCDO95954 541 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CYP2C8P10632 490 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CBX1P83916 185 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 KAT5Q92993 513 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 GPR20Q99678 358 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC11-201ENST00000243082 POTEJP0CG39 1038 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 GTF2H1P32780 548 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 LIG4P49917 911 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 ENPEPQ07075 957 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 WDR78Q5VTH9 848 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 DEPTORQ8TB45 409 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 LGR5O75473 907 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 PIGRP01833 764 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 SCP2P22307 547 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 GPC3P51654 580 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 GALCP54803 685 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 VSNL1P62760 191 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 STRN3Q13033 797 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 GPR162Q16538 588 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 EFCC1Q9HA90 598 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 K7ERI5 159 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 EXTL3O43909 919 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D8O95759 1140 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 ITIH3Q06033 890 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 SV2AQ7L0J3 742 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC57Q8N9N7 239 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TAS1R2Q8TE23 839 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 KREMEN1Q96MU8 473 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 AZI2Q9H6S1 392 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF233A6NK53 670 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 ATP8B1O43520 1251 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TNFAIP3P21580 790 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 C2orf54Q08AI8 447 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 DRP2Q13474 957 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 WDR93Q6P2C0 686 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 USP37Q86T82 979 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 PALB2Q86YC2 1186 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 FBXL13Q8NEE6 735 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TPCN2Q8NHX9 752 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 AGPAT1Q99943 283 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 CLEC11AQ9Y240 323 aa20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 UNCXA6NJT0 531 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TUBBP07437 444 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 DLATP10515 647 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 NOP2P46087 812 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 CAPSQ13938 189 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM50Q86XT4 487 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 FAM71AQ8IYT1 594 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA4Q8NEY3 305 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 HELQQ8TDG4 1101 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 SLC20A1Q8WUM9 679 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 FAM167AQ96KS9 214 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM134Q9H6X4 195 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF408Q9H9D4 720 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 KIAA1586Q9HCI6 787 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 RAB20Q9NX57 234 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 EHD2Q9NZN4 543 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC11-201ENST00000243082 PNMA3Q9UL41 463 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms