RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q80ZQ3 298 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mettl13Q91YR5 698 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rnf112Q96DY5 654 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 MagohbQ9CQL1 146 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 KynuQ9CXF0 464 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Iqcf1Q9D9K8 182 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cmtr1Q9DBC3 837 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gkap1Q9JMB0 366 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm15448F6PZL4 682 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Capn2O08529 700 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Slc10a5Q5PT54 434 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bcar1Q61140 874 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sin3bQ62141 1098 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bud13Q8R149 637 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pde6cQ91ZQ1 861 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pramef12Q9D2F1 463 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PfasQ5SUR0 1337 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf609Q8BZ47 1413 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm5926E9PWJ8 236 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm3182K7N6T8 263 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 VdrP48281 422 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stmn4P63042 189 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ascc2Q91WR3 749 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bag2Q91YN9 210 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ubiad1Q9DC60 336 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Strn3Q9ERG2 796 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc6D3YZP9 469 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Serpinb6eI7HJI3 429 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Prom1O54990 867 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Krt8P11679 490 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gbp1Q01514 589 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ankrd45Q810N6 248 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf445Q8R2V3 986 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smc6Q924W5 1097 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PdgfdQ925I7 370 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vps33aQ9D2N9 598 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rabl3Q9D4V7 236 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rsrc1Q9DBU6 334 aa12.89□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Oip5A2AQ14 241 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Heatr4E9Q357 955 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Foxn2E9Q7L6 429 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BhmtO35490 407 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kcnma1Q08460 1209 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ano5Q75UR0 904 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mageb18Q8BQR7 327 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tlr3Q99MB1 905 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf654Q9DAU9 571 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fen1P39749 378 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q6DFW0 481 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 FktnQ8R507 461 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam49bQ921M7 324 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fuca2Q99KR8 461 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rmi1Q9D4G9 616 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Styxl1Q9DAR2 321 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stk4Q9JI11 487 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CopeO89079 308 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PrkcbP68404 671 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cuedc2Q9CXX9 284 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cnga3Q9JJZ8 631 aa12.88□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Apol7bB1AQP7 369 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sptlc1O35704 473 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 EporP14753 507 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Apba2P98084 750 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 9130409I23RikQ3TS87 320 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Apol7eQ3UZ24 369 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Clul1Q3ZRW6 464 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lrrn2Q6PHP6 730 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 LgsnQ8CIX8 563 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 AagabQ8R2R3 316 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Angptl3Q9R182 455 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 XdhQ00519 1335 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SynrgQ5SV85 1306 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Abcb11Q9QY30 1321 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ric1Q69ZJ7 1422 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mroh7A2AVR2 1279 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cops5O35864 334 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mmp10O55123 476 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Psmc1P62192 440 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Grm1P97772 1199 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Avpr1aQ62463 423 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Taf12Q8VE65 161 aa12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.2 ms