RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C UGA1P17649 471 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C GPI12P23797 304 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C AGA2P32781 87 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C GPX1P36014 167 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YBR062CP38239 180 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RRF1P38771 230 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PCL7P40186 285 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ASG7P46993 209 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CPR7P47103 393 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C UBC13P52490 153 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ZRG17P53735 605 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ARP5P53946 755 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SPO19Q03029 223 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SEC13Q04491 297 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ECM18Q04623 453 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CUP2P15315 225 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C DBP3P20447 523 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CSM1P25651 190 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CDC13P32797 924 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C IMP3P32899 183 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C AST1P35183 429 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C TPO5P36029 618 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SPO73P40031 143 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C GDS1P41913 522 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YPR195CQ06594 109 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ERP3Q12403 225 aa1.29□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C IFM1P25038 676 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C DAL80P26343 269 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C VAB2P40003 282 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YGL185CP53100 379 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C DIA1P54005 336 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ACT1P60010 375 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YPL077CQ02831 240 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C TAZ1Q06510 381 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YLR413WQ06689 675 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ASR1Q06834 288 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YPL278CQ08990 100 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YPR064WQ12492 139 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ATP6P00854 259 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C GAL7P08431 366 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C HPR1P17629 752 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MRPL6P32904 214 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YKL063CP35725 167 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RPC37P36121 282 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C AIM29P36154 155 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C VPS45P38932 577 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YIL059CP40520 121 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C COS4P43542 379 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C AGP3P43548 558 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C GTO1P48239 356 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C KEL2P50090 882 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RPN14P53196 417 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ERV25P54837 211 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C VTI1Q04338 217 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ERV41Q04651 352 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PEX30Q06169 523 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa1.28□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YCR025CP25352 136 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C HIS2P38635 335 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C TDA11P38854 504 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YIL012WP40551 113 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YNL260CP53846 198 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YNL050CP53952 270 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C BCP1Q06338 283 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C BER1Q06688 274 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YPL264CQ08980 353 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C POM33Q12164 279 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YAL063C-AQ3E791 96 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C TFS1P14306 219 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C IMP1P28627 190 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C VPH2P32341 215 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ARO4P32449 370 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YKL070WP36087 169 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YIA6P40556 373 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YFL064CP43540 174 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C MPP10P47083 593 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C PRP24P49960 444 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YPT32P51996 222 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C DPP1Q05521 289 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C GPN3Q06543 272 aa1.27□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ILV1P00927 576 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C CDC42P19073 191 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C DAL81P21657 970 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C AEP1P32493 518 aa1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C GCG1P32656 232 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
HDA3YPR179C RPS0AP32905 252 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
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