RNA–Protein interactions for RNA: YHR129C

ARP1, Transcript of Actin-related protein of the dynactin complex, yeast

Gene ARP1, Length 1,155 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP1	YHR129C	TYR1	P20049	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	ZRT1	P32804	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	LST4	P34239	828 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	ELF1	P36053	145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	WSC4	P38739	605 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YHI9	P38765	294 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	SYG1	P40528	902 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	AIM34	Q03673	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	HRD3	Q05787	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	GRX8	Q05926	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	MHR1	Q06630	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	IRC13	Q08630	104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	ICT1	Q12385	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	AGC1	Q12482	902 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	CUP2	P15315	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	SEC22	P22214	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	DCC1	P25559	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	POF1	P25576	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YKL187C	P34231	750 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	JEN1	P36035	616 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	IST2	P38250	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	MET30	P39014	640 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RMD6	P39975	231 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	HPM1	P40481	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YIA6	P40556	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	GUF1	P46943	645 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YJR012C	P47087	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	TOS2	P50078	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	DUG3	P53871	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YNL095C	P53932	642 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	CDC14	Q00684	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	TMA10	Q06177	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	CTR3	Q06686	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	HEM25	Q07534	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	SGT1	Q08446	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RKI1	Q12189	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YCT1	Q12235	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RGT2	Q12300	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	TOA2	P32774	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
ARP1	YHR129C	YHR035W	P38769	630 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	FAA2	P39518	744 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	VPS52	P39904	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	IRC18	P47056	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RIM8	P53179	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	CAF40	P53829	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	ASI3	P53983	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	AAT1	Q01802	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	GLO2	Q05584	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	RDI1	Q12434	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	IZH4	Q99393	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP1	YHR129C	SIR4	P11978	1358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	HEM2	P05373	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	HIS3	P06633	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	MGT1	P26188	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	PMT2	P31382	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	SPS18	P32572	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	COX13	P32799	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	MRPL17	P36528	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	YPT10	P38146	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	YER076C	P40049	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	CSM2	P40465	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	YFL040W	P43562	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	YIP4	P53093	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	PEX31	P53203	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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