RNA–Protein interactions for RNA: YGR246C

BRF1, Transcript of TFIIIB B-related factor, yeast

Gene BRF1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRF1	YGR246C	SDS22	P36047	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	OMA1	P36163	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CDH1	P53197	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FRE3	Q08905	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	URA3	P03962	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	STE50	P25344	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	BUB3	P26449	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PDR3	P33200	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SKN1	P33336	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	LST4	P34239	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YKL077W	P36081	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DTR1	P38125	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	THI2	P38141	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RTC2	P38279	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MED6	P38782	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ATF1	P40353	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	AIM25	P47140	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YNR061C	P53747	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PRM15	Q03262	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MFB1	Q04922	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YEH1	Q07804	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	GLO4	Q12320	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PSF1	Q12488	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	COX9	P07255	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PRE4	P30657	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TAF14	P35189	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YOR062C	P36025	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	APL3	P38065	1025 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FAT1	P38225	669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	LTP1	P40347	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SMK1	P41808	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ASK10	P48361	1146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TOS2	P50078	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	UBC12	P52491	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YGL235W	P53071	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	POP6	P53218	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	VOA1	P53262	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	AQR1	P53943	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HXT11	P54862	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FEX1	Q08913	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PFA4	Q12006	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CDC23	P16522	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	UTR1	P21373	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MGR1	P25573	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ERG3	P32353	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PAU2	P32612	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	LEU5	P38702	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SWM2	P40342	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TED1	P40533	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PMT6	P42934	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HNT2	P49775	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	LCL3	P53153	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YHM2	Q04013	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DLT1	Q04216	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	KEI1	Q06346	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CDA2	Q06703	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SKM1	Q12469	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ARG80	P07249	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ATS1	P31386	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ACB1	P31787	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SFK1	P35735	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
BRF1	YGR246C	SDP1	P40479	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	POP1	P41812	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	BAP3	P41815	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PPT1	P53043	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DOC1	P53068	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	REC102	Q02721	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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