RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 TNFAIP1Q13829 316 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 MMEL1Q495T6 779 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SERPINB12Q96P63 405 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 COA1Q9GZY4 146 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TOM1L1O75674 476 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SCTRP47872 440 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FSCBQ5H9T9 825 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 PADI6Q6TGC4 694 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 RAPGEF5Q92565 580 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 CALN1Q9BXU9 219 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TFR2Q9UP52 801 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 AGLP35573 1532 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FSBPO95073 299 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TTC4O95801 387 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 HSPA2P54652 639 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 PACS2Q86VP3 889 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 METTL13Q8N6R0 699 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 GLG1Q92896 1179 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SCYL1Q96KG9 808 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FGD4Q96M96 766 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 PFDN4Q9NQP4 134 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 GGA2Q9UJY4 613 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 NAGPAQ9UK23 515 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FMO5P49326 533 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 COPS2P61201 443 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 DYNLT1P63172 113 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ERICH1Q86X53 443 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TRABDQ9H4I3 376 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 UBE4BO95155 1302 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM120BA0PK00 339 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FNTAP49354 379 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 JAK3P52333 1124 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 KLC2Q9H0B6 622 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 CD248Q9HCU0 757 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 KCND2Q9NZV8 630 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 USP17L10C9JJH3 530 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 O00370 1275 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 PEX3P56589 373 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 KRT80Q6KB66 452 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087X0T9 212 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ZBED1O96006 694 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 FAM228BP0C875 321 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 UBXN2AP68543 259 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 MAPK7Q13164 816 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 WWP1Q9H0M0 922 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 POLD4Q9HCU8 107 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 P4HA2O15460 535 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 PRPSAP2O60256 369 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 KRT7P08729 469 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF8P28908 595 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SLC29A2Q14542 456 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-205ENST00000577827 SEC23AQ15436 765 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms