RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 TPH2Q8IWU9 490 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CNNM3Q8NE01 707 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 OXER1Q8TDS5 423 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 HAS1Q92839 578 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ZBP1Q9H171 429 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 RGL1Q9NZL6 768 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 EVPLQ92817 2033 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 STK36Q9NRP7 1315 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ERLIN2O94905 339 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ITGA4P13612 1032 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 KLRC2P26717 231 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SLC11A1P49279 550 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NUBP1P53384 320 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 IER5LQ5T953 404 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 FERMT3Q86UX7 667 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CABP7Q86V35 215 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 RNF149Q8NC42 400 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ASIC4Q96FT7 647 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 DYDC2Q96IM9 177 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 LXNQ9BS40 222 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 RSAD1Q9HA92 442 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ZBTB39O15060 712 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NR1I2O75469 434 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 DDHD2O94830 711 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SLITRK3O94933 977 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CTDNEP1O95476 244 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 POMCP01189 267 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NEFLP07196 543 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 WEE2P0C1S8 567 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 EPCAMP16422 314 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 AVPR2P30518 371 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 AXLP30530 894 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 KRT2P35908 639 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ANAPC15P60006 121 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CYP4A11Q02928 519 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 POU5F1BQ06416 359 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MTMR3Q13615 1198 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 TFDP1Q14186 410 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 EMC2Q15006 297 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MTRQ99707 1265 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 POMKQ9H5K3 350 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 DPP7Q9UHL4 492 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 USTQ9Y2C2 406 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 C5orf42Q9H799 3197 aa9.09□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 NRP1O14786 923 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 DGAT1O75907 488 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 LYPLA2O95372 231 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 TXKP42681 527 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 AK2P54819 239 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 PTENP60484 403 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.08□□□□□ -0.96
COCH-211ENST00000557065 NR5A1Q13285 461 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms