RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539741.5

TM7SF3-208, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-208ENST00000539741 RETREG2Q8NC44 543 aa21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 BSNDQ8WZ55 320 aa21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TBX20Q9UMR3 447 aa21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 H3BRB1 525 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 MAGEB2O15479 319 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 NRDCO43847 1150 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TPM1P09493 284 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF286BP0CG31 522 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 PTGS1P23219 599 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 UBXN1Q04323 297 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 KCNA1Q09470 495 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 SNX17Q15036 470 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 DEPTORQ8TB45 409 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TMEM143Q96AN5 459 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 SEPT4O43236 478 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TEX33O43247 280 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 ADCY6O43306 1168 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 GLRA2P23416 452 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 VWA3BQ502W6 1294 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 IQCDQ96DY2 449 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 F2P00734 622 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 STRN3Q13033 797 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TFDP1Q14186 410 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 KSR1Q8IVT5 923 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 NDST4Q9H3R1 872 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 DMAC2Q9NW81 257 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-208ENST00000539741 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ASAP2O43150 1006 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 KPNA6O60684 536 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 C22orf31O95567 290 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 INSRRP14616 1297 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 EFNA5P52803 228 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 PPFIA1Q13136 1202 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 MIIPQ5JXC2 388 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 CEP135Q66GS9 1140 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 CLIC2O15247 247 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 MAPK13O15264 365 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 TMOD1P28289 359 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 TLE2Q04725 743 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 CAPSQ13938 189 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 SPC25Q9HBM1 224 aa21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.096e-10■■■■■ 31.3
TM7SF3-208ENST00000539741 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 AKAP3O75969 853 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 CYP2J2P51589 502 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 BICD1Q96G01 975 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 NUP58Q9BVL2 599 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 EXOC3O60645 756 aa21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 PIGRP01833 764 aa21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 GARTP22102 1010 aa21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 GRIK4Q16099 956 aa21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-208ENST00000539741 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms