RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	SMTN	P53814	917 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	USP49	Q70CQ1	688 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SPRED2	Q7Z698	418 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CNNM3	Q8NE01	707 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	URGCP	Q8TCY9	931 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PPM1E	Q8WY54	764 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	EPOP	A6NHQ4	379 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SFI1	A8K8P3	1242 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059		K7ERI5	159 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	N4BP3	O15049	544 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	B4GALT5	O43286	388 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	NPTXR	O95502	500 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ITGA4	P13612	1032 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PLS3	P13797	630 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	NPTX2	P47972	431 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	NUCB2	P80303	420 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	STRN3	Q13033	797 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	GPM6B	Q13491	265 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PTPRO	Q16827	1216 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SV2B	Q7L1I2	683 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PDILT	Q8N807	584 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	LPP	Q93052	612 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SPATA32	Q96LK8	384 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	APOL6	Q9BWW8	343 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059		H0YCG3	227 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SLC16A4	O15374	487 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CSPG5	O95196	566 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	RB1	P06400	928 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	LAG3	P18627	525 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	DDIT3	P35638	169 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	AMHR2	Q16671	573 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	FAM187B	Q17R55	369 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	REEP2	Q9BRK0	252 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PANK2	Q9BZ23	570 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	RSAD1	Q9HA92	442 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059		K7ENM7	598 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ACKR2	O00590	384 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF623	O75123	536 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	BMPR1A	P36894	532 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	MAPK7	Q13164	816 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ADGRE1	Q14246	886 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	DYM	Q7RTS9	669 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	DAW1	Q8N136	415 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	MYCT1	Q8N699	235 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	DHX58	Q96C10	678 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	BICD1	Q96G01	975 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CASD1	Q96PB1	797 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PLVAP	Q9BX97	442 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	FZD8	Q9H461	694 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	PARVG	Q9HBI0	331 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	IPP	Q9Y573	584 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059		H3BNC9	293 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	UBXN11	Q5T124	520 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CHID1-222	ENST00000533059	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		15.22	■□□□□ 0.03

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