RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 KIF3CO14782 793 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ZMYND10O75800 440 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CLSTN1O94985 981 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 NEDD9Q14511 834 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TRIM50Q86XT4 487 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 RUFY1Q96T51 708 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PARVGQ9HBI0 331 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TFR2Q9UP52 801 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 LYPLA2O95372 231 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 EPHB4P54760 987 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PRKCEQ02156 737 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC42Q96M95 316 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CEP350Q5VT06 3117 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ODR4Q5SWX8 454 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 EMC10Q5UCC4 262 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ARMCX2Q7L311 632 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MAF1Q9H063 256 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.93■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 HSF2BPO75031 334 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PSAPP07602 524 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TNFRSF8P28908 595 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF131P52739 623 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 APBA1Q02410 837 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SPA17Q15506 151 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CAVIN3Q969G5 261 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 NNTQ13423 1086 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.92■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 EPHB6O15197 1021 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CLIC2O15247 247 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PRLRP16471 622 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 COPB2P35606 906 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CCNA1P78396 465 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 DRP2Q13474 957 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CEP170P1Q96L14 293 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 RCCD1A6NED2 376 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TISP43B9A030 160 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SMTNP53814 917 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CYP27A1Q02318 531 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 KIF5AQ12840 1032 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.91■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ATG7O95352 703 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 VAV2P52735 878 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 BSNDQ8WZ55 320 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 EPN3Q9H201 632 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MCM8Q9UJA3 840 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MYO1FO00160 1098 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TGFB1I1O43294 461 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 SLC10A3P09131 477 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MARK3P27448 753 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 C2orf54Q08AI8 447 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MTERF2Q49AM1 385 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 RDM1Q8NG50 284 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.9■■□□□ 1.1
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF302Q9NR11 478 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms