RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NAMPTP43490 491 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KLK7P49862 253 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MXI1P50539 228 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CASP5P51878 434 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 JAG1P78504 1218 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CAV1Q03135 178 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LMNB2Q03252 620 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TAP1Q03518 808 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPATQ06203 517 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BIRC3Q13489 604 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPC2Q52LR7 807 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 XKR9Q5GH70 373 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZPBP2Q6X784 338 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MICALL2Q8IY33 904 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GPD1LQ8N335 351 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GJA10Q969M2 543 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KLRG1Q96E93 195 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NT5C1BQ96P26 610 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGPAT1Q99943 283 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SIX2Q9NPC8 291 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNF146Q9NTX7 359 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HACL1Q9UJ83 578 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RLFQ13129 1914 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPHB6O15197 1021 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CHMP2AO43633 222 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EXTL3O43909 919 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZEB2O60315 1214 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CHRNA3P32297 505 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ACTN2P35609 894 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTP4A2Q12974 167 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPP2Q13103 211 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTPN21Q16825 1174 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IER5Q5VY09 327 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DAAM2Q86T65 1068 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BBOF1Q8ND07 529 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 REPS2Q8NFH8 660 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LMO3Q8TAP4 145 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SHC3Q92529 594 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC102AQ96A19 550 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CEP170P1Q96L14 293 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CEP89Q96ST8 783 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PNKPQ96T60 521 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SH3GL2Q99962 352 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYT11Q9BT88 431 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MIS12Q9H081 205 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GGA2Q9UJY4 613 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms