RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	CTSA	P10619	480 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	EPCAM	P16422	314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ITIH3	Q06033	890 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	IER5L	Q5T953	404 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	WASF1	Q92558	559 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	FOSB	P53539	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MTR	Q99707	1265 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ASAP2	O43150	1006 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TSPAN1	O60635	241 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	JAK2	O60674	1132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	POMC	P01189	267 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	NEFL	P07196	543 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MRE11	P49959	708 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PTEN	P60484	403 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	GIT2	Q14161	759 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A087WWV3	80 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ERLIN2	O94905	339 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	LYPLA2	O95372	231 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ALDH2	P05091	517 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MTHFR	P42898	656 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	CALCRL	Q16602	461 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	IPP	Q9Y573	584 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	NRP1	O14786	923 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	LILRB3	O75022	631 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ITGA4	P13612	1032 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ARL2	P36404	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TXK	P42681	527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	CAPS	Q13938	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms